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#1 18-01-2020 03:55:24

Diana Hope
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Date d'inscription: 18-01-2020
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puma future

ÿþNach Entfernung inkorporierter Primersequenzen und Fragmentkanten von geringer Qualität wurden doppelsträngige puma future Sequenzen für ein 669-bp-Segment des mtDNA-ND5-Gens für 156 in Südamerika, 17 in Mittelamerika und 13 in Nordamerika beprobte Puma-Individuen erhalten ( Tabelle S1, Abbildung 1). Zusätzliche Sequenzen desselben Fragments wurden für zwei P. yagouaroundi-Individuen erhalten. Geographische Verteilung der hier analysierten Puma-Concolor-Proben. Blaue Linien kennzeichnen drei große Flüsse.

Wenn die P. yagouaroundi-Sequenzen als Outgroups im Netzwerk verwendet wurden (Abbildung 2A), wurden sie durch 85 Mutationsschritte mit dem Puma-Haplotyp H01 verbunden, wodurch diese Position für die Puma-mtDNA-Wurzel unterstützt wurde. Der Haplotyp H01 ist in Südamerika (Paraguay sowie in den brasilianischen Staaten MS, SP und MG) zu finden und unterscheidet sich durch mindestens sechs Mutationsschritte von den wichtigsten nord- und mittelamerikanischen Haplotypen. Als die M. trumani-Sequenz in das Netzwerk aufgenommen wurde puma sneaker (2B), wurde die Sequenzausrichtungslänge auf 286 bp reduziert, um dem für diese Außengruppe verfügbaren Segment zu entsprechen.

Die mit Beast durchgeführten Bayes'schen Analysen haben weiter geholfen, Licht in die historischen Demografie-Pumas zu bringen, wie sie durch die mtDNA aufgedeckt wurden. In der ersten puma suede classic Analyserunde haben wir unter Verwendung von fünf Personen mit den unterschiedlichsten Haplotypen und zwei Jaguarundis die Substitutionsrate des analysierten ND5-Segments auf 2,054% pro Million Jahre (MY) geschätzt. Unter Verwendung dieser Substitutionsrate in der zweiten Reihe von Analysen ermittelten wir einen mittleren t MRCA von 0,237 MYA (95% HPD: 0,105 0,391 MYA). Für südamerikanische Puma wurde der mittlere t MRCA auf 0,211 (0,091 0,353) MYA geschätzt.

Bayesian Skyline-Diagramme, die aus einem Alignment von puma ND5-Sequenzen abgeleitet wurden. In (A) wurde die Analyse für alle Puma-Proben und in puma bmw (B) nur für südamerikanische Puma durchgeführt. Die dicke durchgezogene Linie stellt den Mittelwert dar, während die 95% -HPD-Grenzen (höchste hintere Dichte) durch die blauen Bereiche angezeigt werden. Die vertikalen gestrichelten Linien beziehen sich auf die t MRCA, wobei die dünne Linie die untere 95% -HPD-Grenze angibt und die dicke Linie den Mittelwert darstellt. Die x-Achse ist auf einer Jahrmillionenskala (Myr) dargestellt. Die y-Achse repräsentiert die effektive Populationsgröße (N e) multipliziert mit der Generationszeit (auch in myr). Unter der Annahme einer Generierungszeit von 5 Jahren sollten die Zahlen auf dieser Achse mit 200.000 multipliziert werden, um interpretierbare Werte zu erhalten.

Dies deutet auf eine fortgesetzte matrilineare Konnektivität zwischen diesen Gebieten (die notwendigerweise durch Nordsüdamerika führt) oder auf die Beibehaltung eines überlieferten Polymorphismus vor der implizierten phylogeografischen Unterteilung hin. Da die verfügbaren Stichproben für Nordsüdamerika noch bescheiden sind (siehe Abbildung 1), bleiben beide Hypothesen realisierbar und sollten Gegenstand zusätzlicher Untersuchungen sein. Darüber hinaus wurde berichtet, dass der puma bts Nordwesten Südamerikas ein hohes Maß an genetischer Vielfalt und eine komplexe Evolutionsgeschichte für mehrere Säugetiertaxa aufweist (z. B. Eizirik et al., 1998; Ruiz-García et al., 2009, 2010, 2012;

Thoisy et al. , 2010), wobei die Notwendigkeit hervorgehoben wird, Pumas aus diesem Teil ihres Verbreitungsgebiets weiter zu untersuchen, um ihre Rolle in der gesamten phylogeografischen Struktur der Art zu bewerten vor allem in Mittelsüdamerika. Als wir M. trumani als die Außengruppe betrachteten, wurde die Wurzel erneut in erster Linie in Südamerika gelegt, wodurch das Vorkommensgebiet des frühesten Vorfahren der gegenwärtigen Abstammungslinien bestätigt http://www.les-gauchers.com/images/shoes/puma-555rhc.jpg und die Entwicklungsrichtung der Pumas während ihrer Verbreitung aufgezeigt wurde.

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